解读羊水穿刺基因检测报告,科学认知染色体拷贝数变异(CNV)
遗传学检查通常分为分染色体水平和基因水平的检测。再次强调临床上绒毛取样,羊水或脐血穿刺实际上都是指获取胎儿样本的手段而非检测方法。获取胎儿样本后根据不同的临床指征会选择相应的检测手段,如染色体培养核型分析,染色体拷贝数检测,基因检测等。
目前临床上染色体层面最常用的检测方法就是核型分析和染色体拷贝数(CNV)检测。
本系列分为三个小文章,分别从染色体核型、染色体拷贝数变异及基因突变方面跟大家聊聊如何合理的解读羊水穿刺后的检测结果,避免孕妇及家属增加不必要的担忧,但又不耽误常规诊疗。
染色体CNV检测亦可称为“染色体微小缺失微小重复检测”,举个例子:“核型检查”可理解为我们在远处看一个大楼,只能看到这个大楼的外观及高矮胖瘦,而CNV检测就相当于我们用“华为P30 pro”来看这个大楼,这样就能看到每个楼层的情况,如果还不理解的话见下图,当然第四张图纯是为了表示效果并不代表真实情况。
“核型检测” 与 “CNV检测”
“核型检测”与“CNV检测模式图”
目前染色体CNV或者说微缺失微重复检测方法通常有两种:一个通俗叫做“芯片”,一个通俗叫“测序”。实际上准确的叫法一个是【染色体微阵列分析(chromosome microarray analysis, CMA),检测基于芯片平台】;一个是【低深度全基因组测序(copy number variation sequencing, CNV-seq),检测基于高通量测序平台】。这两种方法的专家指南都已经发表,但需要特别特别强调的是这两个技术都是检测染色体层面的,跟基因没什么关系,千万不要以为做这两个检测就能把单基因病检测出来。另外,大家不用特别纠结这两种检测方法的区别,对于临床诊断来说都足够。
再来说说染色体CNV检测的结果,大致可以分三类:【完全正常或多态性】,【致病性片段】及【临床意义未明】。值得一提的是,由于分子遗传学检测技术的发展,比如染色体CNV检测,染色体层面的产前诊断的时间不再局限于细胞培养的最佳时间(18-26周),脐血穿刺也几乎被羊水取代。下面我以几个盛京医院羊水报告来举例,大概讲讲如何解读这三个结果。
盛京医院报告样式
1.完全正常或多态
完全正常或多态:通常看见这两种即代表并未检出异常,可以认为染色体是正常的。只要产检时拿给医生看下即可。
下面是两份结果为含有致病片段的报告:
2.致病性片段
致病性片段:通常导致胎儿畸形或出生缺陷。如果报告上描述的畸形与胎儿超声有相符合的症状,那就更加提高胎儿患病的风险,这时应立即找专业的产前诊断医生进行下一步处置。
3.临床意义未明片段
这种情况是临床上最常见的,出现这样的结果通常应为这样的片段数据库没有记载,同时文献中也无法查到其是否致病。由于技术的发展,我们每天都会检测出来很多新的未知的变异,这些变异是否致病目前尚不清楚,缺乏大的数据的统计,但随着数据积累的越来越多,我们对这些变异的功能都会搞清楚(这也是我工作的一个内容)。对于这样的片段的理解通常如下:
(1)如果缺失片段在1Mb以下,重复片段在1.5Mb以下,而且不包含基因,一般来说应该只是个正常变异,绝大部分都是遗传自正常双亲,所以当看到报告里写着有0._Mb缺失重复的时候,千万别上火动了胎气,尤其是超声未提示任何异常,这时请按照正常产检的心情来咨询并进行下一步诊治;
(2)当缺失重复片段较大,且不包含任何基因,也无任何超声异常时,请不要着急上火,速来找专业医生咨询,我们见过正常人缺失7MB情况,没有任何异常,胎儿也携了这个缺失片段,生后亦无异常;
(3)无论缺失重复片段大小与否,如果包含相关基因,也请不要着急,速来找专业医生咨询并验证该判断来源,如果该片段是从双亲遗传下来的,通常也不会致病。
(4)对于临床意义未明片段通常诊断最准确的方法就是验证父母并结合超声!
下面是一份结果为含有临床意义不明的报告:
以上内容只是临床上比较常见的简单的情况的解读和处理,主要还是为了降低孕妇及家属的心理压力做的科普。
医学发展到今天也并未完全对神秘的人体研究透彻,真相有时令人大跌眼镜。因此,千万不能根据以上内容自己决定胎儿的去留,这是需要专业的医生来判断的。最后,无论任何情况下,如有不懂和疑问,请一定到正规的产前诊断中心找专业的医生进行遗传咨询。